吕骥

基本信息Personal Information

讲师

性别 : 男

毕业院校 : 吉林大学

学历 : 博士研究生毕业

学位 : 博士学位

在职信息 : 在岗

所在单位 : 计算机科学与技术学院

入职时间 : 2024年08月13日

办公地点 : 21栋-5-2-1

Email :

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个人简介Personal Profile

吕骥,浙江师范大学计算机科学与技术学院讲师,“AI+”研究中心主任助理,江苏徐州人。2024年6月于吉林大学计算机科学与技术学院获得工学博士学位,师从刘桂霞教授。2018年6月于吉林大学理论化学研究所获得理学硕士学位,师从高加力教授。2017年3月-2017年8月于美国明尼苏达大学化学系交流学习。目前主要从事抗菌药物相关的生物信息学研究。近年来,以第一作者身份(含共同一作)在Briefings in Bioinformatics, Computers in Biology and Medicine, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, Journal of Chemical Information and Modeling, Analytical Chemistry, Journal of Physical Chemistry B等国内外学术期刊发表论文十余篇。相关研究成果曾被美国化学会新闻周刊PressPac,英国皇家化学会Chemistry world等权威新闻媒体专题报道。


所获荣誉:

2025  第四届“成泰共好”奖教金

科研项目:

1. 药物相似性及其在药物相互作用网络中的应用,吉林大学研究生创新研究项目,2022年-2023年,主持

2. 基于多源信息融合的抗菌药物组合预测方法研究,国家自然科学基金面上项目,2024年-2027年,参与

3. 微环境对化学过程立体选择性影响的计算研究,国家自然科学基金面上项目,2016年-2018年,参与

4. 振动光谱解析生物分子结构和动力学,国家自然科学基金重点项目,2016年-2020年,参与

5. 发展全量子力学反应力场系统模拟燃烧反应过程,国家自然科学基金重大研究计划,2017年-2021年,参与

论文列表(*通讯作者,#共同第一作者):

1. Xiangrun Zhou, Guixia Liu*, Chenjing Han, Ji Lv*. ABPDB: a database of antibacterial peptides. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics2025, accepted. (CCF B类期刊)

2. Shuyuan Cao, Guixia Liu*, Xiangrun Zhou, Ji Lv*. A comprehensive review of cluster methods for drug-drug interaction networkQuantitative Biology2025, accepted. (CAA B类期刊)

3. Xiangrun Zhou, Guixia Liu*, Shuyuan Cao, Ji Lv*. Deep Learning for Antimicrobial Peptides: Computational Models and Databases. Journal of Chemical Information and Modeling2025, 63(4), 1708-1717. (中科院2区TOP)

4. Ji Lv, Guixia Liu*, Yuan Ju, Houhou Huang, Ying Sun. Measuring drug similarity in drug-drug interaction network. Quantitative Biology, 2024, 12(2), 164-172. (CAA B类期刊)

5. Ji Lv, Guixia Liu*, Yuan Ju, Binwen Sun, Houhou Huang, Ying Sun. Integrating multi-source drug information to cluster drug-drug interaction network. Computers in Biology and Medicine, 2023, 162, 107088. (中科院1)

6. Ji Lv, Guixia Liu*, Yuan Ju, Houhou Huang, Ying Sun. AADB: a manually collected database for combinations of antibiotics with adjuvants. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2023, 20(5), 2827-2836. (CCF B类期刊)

7. Ji Lv, Guixia Liu*, Yuan Ju, Houhou Huang, Dalin Li, Ying Sun. Identification of robust antibiotic subgroups by integrating multi-species drug-drug interactions. Journal of Chemical Information and Modeling, 2023, 63(15), 4970-4978. (中科院2TOP)

8. Ji Lv#, Mengmeng Zhang#, Yujie Fu, Mengshuang, Chen, Binjie Chen, Zhiyuan Xu, Xianliang Yan*, Shuqun Hu*, Ningjun Zhao*. An interpretable machine learning approach for predicting 30-day readmission after stroke. International Journal of Medical Informatics, 2023, 174, 105050. (中科院2)

9. Xiaoying Zhuo#, Ji Lv#, Binjie Chen#, Jia Liu, Yujie Luo, Jie Liu, Xiaowei Xie, Jiao Lu*, Ningjun Zhao*. Combining conventional ultrasound and ultrasound elastography to predict HER2 status in patients with breast cancer. Frontiers in Physiology2023, 14, 1188502. (中科院2TOP)

10. Jing Liu, Ji Lv, Zheyi Liu, Zheng Fang, Can Lai, Shan Zhao, Mingliang Ye, Fangjun Wang*. Enhanced Interfacial H-Bond Networks Promotes the Glycan-Glycan Recognition and Interaction. ACS Applied Materials & Interfaces, 2023, 15(14), 17592-17600. (中科院2TOP)

11. Ji Lv, Guixia Liu*, Junli Hao, Yuan Ju, Binwen Sun, Ying Sun. Computational models, databases, and tools for antibiotic combinations. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(5), bbac309. (CCF B类期刊)

12. Ji Lv, Guixia Liu*, Wenxuan Dong, Yuan Ju, Ying Sun. ACDB: an antibiotic combination database. Frontiers in Pharmacology, 2022, 13: 869983. (中科院2TOP)

13. Ji Lv, Guixai Liu*, Yuan Ju, Ying Sun, Weiying Guo*. Prediction of Synergistic Antibiotic Combinations by Graph Learning. Frontiers in Pharmacology, 2022, 13: 849006. (中科院2TOP)

14. Ji Lv, Senyi Deng, Le Zhang*. A review of artificial intelligence applications for antimicrobial resistance. Biosafety and Health, 2021, 03(1): 22-31. (中华系列期刊)

15. Binwen Sun#, Ji Lv#, Jin Chen, Zheyi Liu, Ye Zhou, Lin Liu, Yan Jin, Fangjun Wang*. Size-Selective VAILase Proteolysis Provides Dynamic Insights into Protein Structures. Analytical Chemistry, 2021, 93(30), 10653-10660. (中科院1TOP)

16. Lei Zhang#, Ji Lv#, Ming Xiao, Li Yang, Le Zhang*. Exploring the Underlying Mechanism of Action of a Traditional Chinese Medicine Formula, Youdujing Ointment, for Cervical Cancer Treatment. Quantitative Biology, 2021, 9(3), 292-303. (CAA B类期刊)

17. Ji Lv, Kaxin Ren, Yakun Chen*. CO2 Diffusion in Various Carbonated Beverages: A Molecular Dynamics Study. Journal of Physical Chemistry B, 2018, 122(5). (中科院2)


专利:

1. 章乐、张雷、吕骥:基于网络药理学的中药作用机制模型的建立方法、系统及装置. 中国国家知识产权局 ZL 2020 10260328.2


会议报告:

1.  Jun 14, 2025 结合酶切-质谱联用与分子动力学模拟解析蛋白质构象变化,第三届生物分子模拟与结构预测学术会议,长春(邀请报告)

2. May 24, 2025 大语言模型赋能药物相互作用研究,第11届全国计算生物学与生物信息学学术会议,济南(口头报告,优秀报告奖)

3. May 24, 2025 EdgeGAT-ABPprd,第11届全国计算生物学与生物信息学学术会议,济南(墙报报告,优秀墙报奖

4. Aug 09, 2024 聚类药物相互作用网络,第九届中国计算机学会生物信息学会议,长春(口头报告,焦点论文)

5. May 12, 2023 Integrating Multi-source Drug Information to Cluster DDI network, 9届全国计算生物学与生物信息学学术会议,徐州(墙报报告,优秀墙报奖)

6. May 05, 2018 Investigating Binding Modes and Allosteric Effect of Disease-Causing Mutations of TRPV4-ARD Induced by ATP, 中国化学会第31届学术年会, 杭州(墙报报告)

7. Aug 08, 2017 CO2 Diffusion in Various Carbonated Beverage: A Molecular Dynamics Study, 15届全国化学动力学会议, 南京(墙报报告)

8. July 01, 2016 Probing the Fungal Light Sensor Vivid Undergoes Light-Induced Dimerization Tendency by Molecular Dynamics Simulations and Markov State Models, 中国化学会第30届学术年会, 大连(墙报报告,优秀墙报奖)

  • 教育经历Education Background
  • 工作经历Work Experience
  • 研究方向Research Focus
  • 社会兼职Social Affiliations
  • 生物信息学
  • 医学信息学
  • 理论与计算化学