Personal Profile

基本情况：

       博士(后)，副教授，硕士生导师，主要从事于药食同源植物资源的开发利用研究。以第一作者或通讯作者在New Phytologist, Plant Biotechnology Journal, Plant Physiology, Horticulture Research, Communications Biology, Industrial Crops and Products, Medicinal Plant Biology等期刊发表论文30余篇，其中1篇入选ESI高被引论文；以第一发明人授权国家发明专利2项，以主要完成人获省级科技进步一等奖1项、自然科学一等奖1项、国家科技进步二等奖提名1项；参编学术专著2部，参与编制省级标准和《政府咨询报告》若干项，其中咨询报告被全国政协采纳；主持或参与项目十余项。在国际共生固氮会议、中国药用植物学大会、长三角植物学研讨会、浙江省遗传学以及浙江省植物学会等会议上作学术报告若干次。学术兼职：新疆兵团高校高层次人才讲座学者，全国药用植物与植物药专业委员会青年委员、浙江省植物学会青年工作委员会委员、浙江省林下经济委员会委员、Horticulture Research及Medicinal Plant Biology期刊青年编委，Genes等SCI期刊客座编辑，GigaScience等SCI期刊审稿人。

研究兴趣：

      以治疗和预防心脑血管疾病的药食同源植物为主要研究对象，通过干实验（生物信息学分析）和湿实验（分子生化实验）技术手段的结合，开展优异种质资源的挖掘及开发利用的研究，具体如下：

      1、利用基因组学、代谢组学、蛋白质组学等多组学联合分析的方法，开展红花、藏红花、黄精等植物资源药食价值的评价及道地性研究；

      2、基于遗传学、系统生物学、分子生物学等技术，解析红花等药用植物次生代谢产物的形成及演化机制，开发功能标记辅助优异品种选育与利用；

      3、基于AlphaFold和分子、生化遗传实验的结合，解析天然产物合成途径关键酶的催化机制，并对酶进行定点改造，实现天然产物异源高效生物合成。

主要项目：

      (1)  2025-2028，国家自然科学基金，面上项目(32470395), 主持，在研。

      (2)  2025-2026,  金华市公益基金，一般项目(2024-4-015)，主持，在研。

      (3)    2024-2026，浙江省自然科学基金，探索一般(LY24C020002)，主持，在研。

(4)    2024-2027，国家自然科学基金，面上项目(32371838)，联合主持，在研。

(5)    2022-2025，国家自然科学基金，地区基金(32160355)，联合主持，在研。

(6)    2020-2022，国家重点实验室开放课题，重点课题(BRZD2003)，主持，结题。

(7)   2019-2020,  湖北省自然科学基金，青年项目(BZQ19001)，主持，结题。

(8)    2015-2017,  中国博士后科学基金面上项目，(2015M582235), 主持，结题。

主要论文（共同第一作者#，通讯作者*）：

(1)  Zhihua Wu#, Hong Liu#, Wei Zhan#, Zhichao Yu, Erdai Qin, Shuo Liu, Tiange Yang, Niyan Xiang, Dave Kudrna, Yan Chen, Seunghee Lee, Gang Li, Rod A. Wing, Jiao Liu, Hairong Xiong, Chunjiao Xia, Yongzhong Xing, Jianwei Zhang* & Rui Qin*. The chromosome-scale reference genome of safflower (Carthamus tinctorius) provides insights into linoleic acid and flavonoid biosynthesis. Plant Biotechnology Journal, 2021, 19(9):1725-1742.

(2)  Zhihua Wu, Meirong Wang, Siyu Yang, Shengcai Chen, Xu Chen, Chang Liu, Shixiang Wang, Haijiao Wang, Bao Zhang, Hong Liu, Rui Qin, and Xuelu Wang*. A global coexpression network of soybean genes gives insight into the evolution of nodulation in non-legumes and legumes. New Phytologist, 2019, 223 (4): 2104-2119. 

(3)   Zhihua Wu#*, Zhenbo Jiang#, Zhijun Li*, Peipei Jiao, Juntuan Zhai, Shuo Liu, Xiaoli Han, Shanhe Zhang, Jianhao Sun, Zhongshuai Gai, Chen Qiu, Jindong Xu, Hong Liu, Rui Qin, Rui Lu. Multi-omics analysis reveals spatiotemporal regulation and function of heteromorphic leaves in Populus. Plant Physiology, 2023, 192(1): 188-204. 

(4)   Qiu Chen, Liu Shuo, Sun Jianhao, Gai Zhongshuai, Han Xiaoli, Jiao Peipei, Zhai Juntuan, Yang Yuqi, Jiang Zhenbo, Liu Hong, Qin Rui, Tie Jun, Wu Zhihua*, Li Zhijun*. DNA methylation profile revealed the dynamically epigenetic regulation of the distinct heteromorphic leaf development in Populus euphratica. Industrial Crops and Products, 2024, 126: 118688.

(5)   Jianhao Sun; Jindong Xu; Chen Qiu; Juntuan Zhai; Shanhe Zhang; Xiao Zhang; Zhihua Wu*; Zhijun Li; The chromosome-scale genome and population genomics reveal the adaptative evolution of Populus pruinosa to desertification environment, Horticulture Research, 2024, uhae034: 1-34.

(6)  Shanhe Zhang^#, Zhihua Wu^#, De Ma^#, Juntuan Zhai, Xiaoli Han, Zhenbo Jiang, Shuo Liu, Jingdong Xu, Peipei Jiao* & Zhijun Li*. Chromosome-scale assemblies of the male and female Populus euphratica genomes reveal the molecular basis of sex determination and sexual dimorphism. Communications Biology, 2022, 1186 (2022). 

(7)   Yuqi Yang, Jianhao Sun, Chen Qiu, Peipei Jiao, Houling Wang, Zhihua Wu* and Zhijun Li. Comparative genomic analysis of the Growth-Regulating Factors-Interacting Factors (GIFs) in six Salicaceae species and functional analysis of PeGIF3 reveals their regulatory role in Populus heteromorphic leaves. BMC Genomics, 2024, (2024) 25:317. 

(8)   Tiange Yang^#, Zhihua Wu^#, Jun Tie, Rui Qin, Jiangqing Wang, Hong Liu. A Comprehensive Analysis of Chloroplast Genome Provides New Insights into the Evolution of the Genus Chrysosplenium. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 14735. 

(9)   Zhongshuai Gai, Juntuan Zhai, Xiangxiang Chen, Peipei Jiao, Shanhe Zhang, Jianhao Sun, Rui Qin, Hong Liu, Zhihua Wu* and Zhijun Li*, Phylogeography reveals geographic and environmental factors driving genetic differentiation of Populus sect. Turanga in northwest China. Frontiers in Plant Science, 2021, 12:705083. 

(10) Zhihua Wu^#, Wen Huang^#, Erdai Qin, Shuo Liu, Huan Liu, Aleel K. Grennan, Hong Liu^* and Rui Qin^*. Comprehensive Identification and Expression Profiling of Circular RNAs During Nodule Development in Phaseolus vulgaris. Frontiers in Plant Science, 2020, 11: 587185. 

(11)  Zhihua Wu, Hong Liu, Wen Huang, Lisha Yi, Erdai Qin, Tiange Yang, Jing Wang and Rui Qin*. Genome-Wide Identification, Characterization, and Regulation of RWP-RK Gene Family in the Nitrogen-Fixing Clade. Plants-Basel, 2020, 9(9):1178. 

(12) Zhihua Wu#, Rui Liao#, Tiange Yang, Xiang Dong, Deqing Lan, Rui Qin and Hong Liu*. Analysis of six chloroplast genomes provides insight into the evolution of Chrysosplenium (Saxifragaceae). BMC Genomics, 2020, 21(1):621.

(13)   Zhihua Wu, Songtao Gui, Zhiwu Quan, Lei Pan, Shuzhen Wang, Weidong Ke, Dequan Liang and Yi Ding*. A precise chloroplast genome of Nelumbo nucifera (Nelumbonaceae) evaluated with Sanger, Illumina MiSeq, and PacBio RS II sequencing platforms: insight into the plastid evolution of basal eudicots. BMC Plant Biology, 2014, 14:289.

(14)  Peipei Jiao#, Zhihua Wu#, Xu Wang, Zhenbo Jiang, Yanqin Wang, Hong Liu, Rui Qin, and Zhijun Li*. Short‑term transcriptomic responses of Populus euphratica roots and leaves to drought stress. Journal of Forestry Research, 2020, 32: 841–853 (2021). 

(15)   Zhihua Wu*, Tiange Yang, Rui Qin, Hong Liu. Complete mitogenome and phylogenetic analysis of the Carthamus tinctorius L. Genes, 2023, 14, 979. 

(16)    Jianhao Sun, Jindong Xu, Wenrui Qu, Xiaoli Han, Chen Qiu, Zhongshuai Gai, Juntuan Zhai, Rui Qin, Hong Liu, Zhihua Wu*, Zhijun Li*. Genome-wide analysis of R2R3-MYB transcription factors reveals their differential responses to drought stress and ABA treatment in desert poplar (Populus euphratica). Gene, 2023, 855(2023):147124.

(17) Songtao Gui#, Zhihua Wu#, Hongyuan Zhang, Yinzhen Zheng, Zhixuan Zhu, Dequan Liang, and Yi Ding*. The mitochondrial genome map of Nelumbo nucifera reveals ancient evolutionary features. Scientific Reports, 2016, 6:30158 | DOI: 10.1038/srep30158.

(18) Zhihua Wu, Songtao Gui, Shuzhen Wang, and Yi Ding*. Molecular evolution and functional characterisation of an ancient phenylalanine ammonia-lyase gene (NnPAL1) from Nelumbo nucifera: novel insight into the evolution of the PAL family in angiosperms. BMC Evolutionary Biology, 2014, 14:100.

(19)  Zhihua Wu, Shuzhen Wang, Jihong Hu, Feng Li, Weidong Ke, and Yi Ding*. Development and characterization of microsatellite markers for Sagittaria trifolia var. sinensis (Alismataceae). American Journal of Botany, 2011, 98:e36-e38. 

(20)  Zhihua Wu, Rui Liao, Xiang Dong, Rui Qin, Hong Liu. Complete chloroplast genome sequence of Carthamus tinctorius L. from PacBio Sequel platform. Mitochondrial DNA Part B, 2019, 4:2635–2636. 

(21)   X.L. HAN, C. QIU, J.H. SUN, J.D. XU, X. ZHANG, J.T. ZHAI, S.H. ZHANG, Z.H. WU*, Z.J. LI*. Identification of AP2/ERF gene family of Salicaceae and their response to salt stress, abscisic acid, and gibberellic acid in Populus euphratica seeds. Biologia Plantarum, 2023, 67: 88-99. 

(22)   WANG, J. N, XU, J. D., SUN, J. H., QIU, C., WU, Z. H.*, LI, Z. J*. Genome-wide identification of TCP transcription factors family in Populus sect. turanga (Populus pruinosa Schrenk and Populus euphratica Olive) revealed the roles of TCPs in leaf morphology. Applied Ecology and Environmental Research, 2023, 21(2):1665-1696. 

(23)   Zhihua Wu^#*; Ruting Li^#; Meihao Sun; Xueli Hu; Meihua Xiao; Zunhong Hu; Peipei Jiao; Shoucheng Pu; Juntuan Zhai; Jiaqiang Zhang; Current advances of Carthamus tinctorius L.: a review of its application and molecular regulation of flavonoid biosynthesis, Medicinal Plant Biology, 2024, 3(e004): 1-11.

(24)    陈向向，盖中帅，翟军团，徐劲东，吴智华*，李志军* 天然胡杨群体遗传多样性及保护单元的构建，生物多样性，2021, 29 (12): 1638–1649.

论文之外的其他主要成果：

     （1）2020年，专著《胡杨和灰杨抗旱的生理与分子机制研究》，科学出版社, 3/11。

     （2）2021年，专著《胡杨和灰杨的异形叶性及生长适应策略》，科学出版社，3/8。

     （3）2021年，国家发明专利，一种基于Illumina技术组装中华金腰叶绿体基因组序列的方法（ZL201910546474.9), 1/5。

     （4）2022年，新疆兵团科技进步一等奖，塔里木河流域胡杨林多维保育恢复关键技术与应用，3/15。

     （5）2023年，国家发明专利，一种利用CLEC基因鉴定猪肉成分的TaqMan荧光定量PCR方法及其应用（ZL201911335337.7），1/6。

     （6）2023年，国家发明专利，基于BSA混池测序分析开发胡杨性别鉴定的特异DNA分子标记（ZL 202011213071.1），2/8；

     （7）2023年，胡杨雌雄株分子鉴定技术规程（DB65/T4640-2022），2/10。

     （8）2023年，政府咨询报告,《关于加大新疆胡杨遗传资源保护及种质资源圃建设的建议》获新疆自治区党委批示并被全国政协所采纳，4/5。

       (9)   2024年，政府咨询报告,《加快中亚胡杨种质资源收集保育与创新挖掘 为胡杨资源利用储备基因库》被全国政协采纳，4/4。

     （10）2024年，新疆兵团自然科学一等奖，胡杨适应干旱的结构生理特征及分子机制，4/6。

人才培养及教学：

    （1）2020年，第四届全国大学生生命科学竞赛一等奖，第一指导老师；

    （2）2021年，第五届全国大学生生命科学竞赛三等奖，第一指导老师。

    （3）2022年，第六届全国大学生生命科学竞赛三等奖，第一指导老师。

    （4）2023年，国家级创新创业训练计划项目，第一指导老师。

    （5）2023年，浙江省第三届高校教师教学创新大赛三等奖。

主讲课程：

       本科生《生物化学与分子生物学》、《分子生物学》；本科生留学生《文献检索与科技论文写作》（全英文）；研究生《高级生物化学》，研究生留学生《现代分子生物学技术》（全英文）。

      ！！！欢迎对生命健康领域、药食同源植物、天然产物合成、生物信息学等研究感兴趣的本科生、研究生同学加入！也十分欢迎具有计算机、数学或化学等学科背景的同学！

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